Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn11P35235 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn11P35235 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn11P35235 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms