Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms