Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh15P33146 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh15P33146 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms