Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc5P32043 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc5P32043 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms