Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd28P31041 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd28P31041 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd28P31041 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms