Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LoxP28301 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LoxP28301 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LoxP28301 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LoxP28301 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LoxP28301 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LoxP28301 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LoxP28301 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LoxP28301 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LoxP28301 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LoxP28301 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LoxP28301 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LoxP28301 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LoxP28301 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LoxP28301 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LoxP28301 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LoxP28301 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LoxP28301 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LoxP28301 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LoxP28301 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LoxP28301 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LoxP28301 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LoxP28301 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LoxP28301 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LoxP28301 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LoxP28301 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LoxP28301 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LoxP28301 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LoxP28301 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LoxP28301 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LoxP28301 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LoxP28301 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LoxP28301 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LoxP28301 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LoxP28301 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LoxP28301 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LoxP28301 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LoxP28301 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LoxP28301 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LoxP28301 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LoxP28301 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LoxP28301 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LoxP28301 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LoxP28301 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LoxP28301 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LoxP28301 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LoxP28301 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LoxP28301 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LoxP28301 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LoxP28301 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LoxP28301 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LoxP28301 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LoxP28301 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LoxP28301 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LoxP28301 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LoxP28301 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LoxP28301 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LoxP28301 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LoxP28301 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LoxP28301 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LoxP28301 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LoxP28301 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LoxP28301 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LoxP28301 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LoxP28301 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LoxP28301 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LoxP28301 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LoxP28301 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LoxP28301 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LoxP28301 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LoxP28301 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LoxP28301 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LoxP28301 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LoxP28301 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LoxP28301 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LoxP28301 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LoxP28301 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LoxP28301 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LoxP28301 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LoxP28301 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms