Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NdnP25233 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NdnP25233 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NdnP25233 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NdnP25233 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NdnP25233 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NdnP25233 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NdnP25233 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NdnP25233 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NdnP25233 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NdnP25233 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NdnP25233 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NdnP25233 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NdnP25233 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NdnP25233 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NdnP25233 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NdnP25233 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NdnP25233 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NdnP25233 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NdnP25233 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NdnP25233 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NdnP25233 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NdnP25233 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NdnP25233 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NdnP25233 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NdnP25233 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NdnP25233 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NdnP25233 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NdnP25233 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NdnP25233 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NdnP25233 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NdnP25233 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NdnP25233 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NdnP25233 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NdnP25233 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NdnP25233 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NdnP25233 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NdnP25233 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NdnP25233 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NdnP25233 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NdnP25233 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NdnP25233 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NdnP25233 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NdnP25233 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NdnP25233 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NdnP25233 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NdnP25233 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NdnP25233 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NdnP25233 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NdnP25233 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NdnP25233 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NdnP25233 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NdnP25233 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NdnP25233 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NdnP25233 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NdnP25233 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NdnP25233 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NdnP25233 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NdnP25233 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NdnP25233 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NdnP25233 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NdnP25233 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NdnP25233 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NdnP25233 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NdnP25233 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NdnP25233 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms