Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZfaP23607 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZfaP23607 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZfaP23607 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZfaP23607 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZfaP23607 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZfaP23607 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZfaP23607 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZfaP23607 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZfaP23607 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZfaP23607 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZfaP23607 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZfaP23607 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms