Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxb1P17919 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb1P17919 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb1P17919 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms