Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn1P12960 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn1P12960 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn1P12960 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms