Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms