Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LtkP08923 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LtkP08923 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LtkP08923 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LtkP08923 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtkP08923 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtkP08923 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LtkP08923 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtkP08923 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtkP08923 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtkP08923 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtkP08923 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtkP08923 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtkP08923 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtkP08923 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtkP08923 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtkP08923 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtkP08923 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtkP08923 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtkP08923 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtkP08923 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtkP08923 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtkP08923 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtkP08923 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LtkP08923 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LtkP08923 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LtkP08923 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LtkP08923 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LtkP08923 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LtkP08923 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LtkP08923 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LtkP08923 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LtkP08923 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LtkP08923 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LtkP08923 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LtkP08923 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LtkP08923 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LtkP08923 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LtkP08923 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LtkP08923 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LtkP08923 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LtkP08923 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LtkP08923 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LtkP08923 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LtkP08923 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LtkP08923 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LtkP08923 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LtkP08923 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LtkP08923 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LtkP08923 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LtkP08923 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LtkP08923 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LtkP08923 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LtkP08923 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LtkP08923 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LtkP08923 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LtkP08923 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtkP08923 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtkP08923 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtkP08923 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtkP08923 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtkP08923 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtkP08923 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtkP08923 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtkP08923 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtkP08923 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtkP08923 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtkP08923 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtkP08923 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtkP08923 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtkP08923 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtkP08923 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtkP08923 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LtkP08923 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LtkP08923 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtkP08923 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtkP08923 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtkP08923 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtkP08923 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtkP08923 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtkP08923 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtkP08923 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtkP08923 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtkP08923 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtkP08923 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LtkP08923 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtkP08923 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtkP08923 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtkP08923 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtkP08923 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtkP08923 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LtkP08923 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtkP08923 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtkP08923 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtkP08923 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtkP08923 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtkP08923 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtkP08923 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtkP08923 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtkP08923 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms