Protein–RNA interactions for Protein: P08152

Egr2, E3 SUMO-protein ligase EGR2, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr2P08152 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr2P08152 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr2P08152 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr2P08152 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr2P08152 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Egr2P08152 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr2P08152 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr2P08152 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr2P08152 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr2P08152 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr2P08152 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Egr2P08152 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms