Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna4P07351 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms