Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TnfP06804 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TnfP06804 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TnfP06804 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TnfP06804 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TnfP06804 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TnfP06804 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TnfP06804 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TnfP06804 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TnfP06804 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TnfP06804 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TnfP06804 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TnfP06804 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TnfP06804 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TnfP06804 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TnfP06804 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TnfP06804 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TnfP06804 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TnfP06804 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TnfP06804 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TnfP06804 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TnfP06804 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TnfP06804 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TnfP06804 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TnfP06804 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TnfP06804 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TnfP06804 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TnfP06804 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TnfP06804 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TnfP06804 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TnfP06804 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TnfP06804 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TnfP06804 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TnfP06804 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TnfP06804 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TnfP06804 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TnfP06804 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TnfP06804 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TnfP06804 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TnfP06804 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TnfP06804 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TnfP06804 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TnfP06804 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TnfP06804 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TnfP06804 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TnfP06804 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TnfP06804 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TnfP06804 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TnfP06804 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TnfP06804 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TnfP06804 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TnfP06804 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TnfP06804 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TnfP06804 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TnfP06804 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TnfP06804 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TnfP06804 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TnfP06804 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TnfP06804 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TnfP06804 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TnfP06804 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TnfP06804 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TnfP06804 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TnfP06804 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TnfP06804 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TnfP06804 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TnfP06804 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TnfP06804 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TnfP06804 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TnfP06804 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TnfP06804 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
TnfP06804 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TnfP06804 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TnfP06804 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TnfP06804 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TnfP06804 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TnfP06804 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TnfP06804 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TnfP06804 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TnfP06804 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TnfP06804 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TnfP06804 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TnfP06804 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TnfP06804 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TnfP06804 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TnfP06804 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TnfP06804 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TnfP06804 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TnfP06804 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TnfP06804 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TnfP06804 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TnfP06804 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TnfP06804 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TnfP06804 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TnfP06804 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TnfP06804 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TnfP06804 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TnfP06804 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TnfP06804 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TnfP06804 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms