Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Me1P06801 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Me1P06801 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Me1P06801 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Me1P06801 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Me1P06801 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Me1P06801 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Me1P06801 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Me1P06801 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Me1P06801 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Me1P06801 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Me1P06801 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Me1P06801 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Me1P06801 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Me1P06801 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Me1P06801 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Me1P06801 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Me1P06801 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Me1P06801 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Me1P06801 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Me1P06801 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Me1P06801 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Me1P06801 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Me1P06801 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Me1P06801 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Me1P06801 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Me1P06801 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Me1P06801 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Me1P06801 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Me1P06801 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Me1P06801 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Me1P06801 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Me1P06801 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Me1P06801 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Me1P06801 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Me1P06801 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Me1P06801 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Me1P06801 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Me1P06801 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Me1P06801 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Me1P06801 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Me1P06801 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Me1P06801 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Me1P06801 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Me1P06801 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Me1P06801 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Me1P06801 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Me1P06801 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Me1P06801 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Me1P06801 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Me1P06801 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Me1P06801 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Me1P06801 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Me1P06801 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Me1P06801 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Me1P06801 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Me1P06801 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Me1P06801 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Me1P06801 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Me1P06801 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Me1P06801 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Me1P06801 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Me1P06801 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Me1P06801 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Me1P06801 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Me1P06801 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Me1P06801 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Me1P06801 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Me1P06801 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Me1P06801 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Me1P06801 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Me1P06801 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Me1P06801 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Me1P06801 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Me1P06801 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Me1P06801 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Me1P06801 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Me1P06801 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Me1P06801 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Me1P06801 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Me1P06801 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Me1P06801 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Me1P06801 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Me1P06801 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Me1P06801 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Me1P06801 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Me1P06801 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Me1P06801 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Me1P06801 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Me1P06801 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Me1P06801 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Me1P06801 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Me1P06801 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Me1P06801 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Me1P06801 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Me1P06801 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Me1P06801 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Me1P06801 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Me1P06801 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Me1P06801 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms