Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01878 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01878 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01878 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01878 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01878 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01878 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01878 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01878 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01878 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01878 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01878 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01878 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01878 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01878 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01878 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01878 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01878 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01878 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01878 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01878 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01878 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01878 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01878 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01878 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01878 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
P01878 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01878 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01878 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01878 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01878 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01878 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P01878 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01878 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01878 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01878 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01878 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01878 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01878 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01878 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01878 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01878 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01878 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01878 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01878 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01878 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
P01878 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01878 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01878 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
P01878 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01878 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01878 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01878 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01878 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01878 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01878 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P01878 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.3■■□□□ 1
P01878 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01878 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01878 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01878 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.3■■□□□ 1
P01878 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01878 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01878 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01878 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01878 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01878 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01878 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01878 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01878 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01878 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01878 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
P01878 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01878 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
P01878 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
P01878 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01878 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01878 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01878 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01878 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P01878 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P01878 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01878 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.28■■□□□ 1
P01878 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01878 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
P01878 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01878 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01878 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01878 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01878 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01878 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01878 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01878 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01878 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01878 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01878 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P01878 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01878 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01878 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01878 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms