Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01667 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01667 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01667 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01667 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01667 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01667 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01667 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01667 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01667 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01667 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01667 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01667 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01667 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01667 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
P01667 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01667 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01667 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01667 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01667 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01667 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01667 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01667 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01667 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01667 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01667 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01667 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01667 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01667 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
P01667 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01667 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01667 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01667 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01667 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01667 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01667 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01667 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01667 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01667 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
P01667 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01667 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01667 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01667 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01667 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01667 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01667 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01667 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01667 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01667 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
P01667 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01667 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01667 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01667 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01667 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01667 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01667 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01667 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01667 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01667 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01667 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01667 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01667 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01667 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01667 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01667 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
P01667 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01667 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01667 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01667 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01667 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01667 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01667 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01667 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
P01667 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01667 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01667 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
P01667 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01667 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01667 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01667 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01667 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01667 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01667 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01667 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01667 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01667 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01667 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01667 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01667 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01667 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01667 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19■□□□□ 0.63
P01667 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01667 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P01667 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01667 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01667 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01667 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01667 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01667 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01667 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms