Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01648 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01648 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01648 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01648 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
P01648 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01648 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01648 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
P01648 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01648 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01648 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01648 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01648 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01648 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01648 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01648 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01648 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01648 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01648 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01648 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01648 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P01648 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P01648 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P01648 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01648 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01648 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01648 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
P01648 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01648 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01648 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01648 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01648 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01648 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01648 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01648 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01648 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01648 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01648 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P01648 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01648 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01648 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P01648 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01648 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01648 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01648 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01648 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01648 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01648 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01648 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01648 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01648 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01648 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01648 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01648 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
P01648 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01648 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01648 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01648 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
P01648 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01648 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01648 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01648 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01648 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01648 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01648 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01648 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01648 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P01648 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01648 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
P01648 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01648 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
P01648 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01648 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
P01648 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01648 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01648 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01648 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01648 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01648 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01648 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01648 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01648 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01648 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01648 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
P01648 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01648 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.28■■□□□ 1
P01648 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01648 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P01648 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P01648 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
P01648 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
P01648 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01648 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01648 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01648 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01648 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01648 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P01648 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
P01648 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
P01648 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms