Protein–RNA interactions for Protein: O88842

Fgd3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd3O88842 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd3O88842 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd3O88842 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd3O88842 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd3O88842 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgd3O88842 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgd3O88842 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgd3O88842 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgd3O88842 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd3O88842 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgd3O88842 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms