Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
F11rO88792 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
F11rO88792 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
F11rO88792 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
F11rO88792 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
F11rO88792 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
F11rO88792 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
F11rO88792 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
F11rO88792 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
F11rO88792 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
F11rO88792 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
F11rO88792 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
F11rO88792 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
F11rO88792 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
F11rO88792 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
F11rO88792 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
F11rO88792 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
F11rO88792 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
F11rO88792 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
F11rO88792 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
F11rO88792 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F11rO88792 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F11rO88792 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F11rO88792 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F11rO88792 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F11rO88792 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F11rO88792 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
F11rO88792 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F11rO88792 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F11rO88792 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
F11rO88792 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F11rO88792 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F11rO88792 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
F11rO88792 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F11rO88792 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F11rO88792 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F11rO88792 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F11rO88792 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F11rO88792 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F11rO88792 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F11rO88792 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F11rO88792 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F11rO88792 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
F11rO88792 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
F11rO88792 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F11rO88792 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
F11rO88792 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
F11rO88792 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F11rO88792 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F11rO88792 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F11rO88792 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
F11rO88792 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
F11rO88792 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
F11rO88792 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
F11rO88792 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
F11rO88792 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
F11rO88792 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
F11rO88792 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
F11rO88792 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
F11rO88792 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
F11rO88792 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
F11rO88792 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
F11rO88792 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
F11rO88792 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
F11rO88792 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
F11rO88792 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
F11rO88792 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
F11rO88792 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F11rO88792 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
F11rO88792 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
F11rO88792 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F11rO88792 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
F11rO88792 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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