Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnt1O88346 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Tnnt1O88346 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms