Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Xirp1O70373 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms