Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf5O70191 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf5O70191 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atf5O70191 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atf5O70191 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf5O70191 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf5O70191 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf5O70191 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms