Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Supt5hO55201 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Supt5hO55201 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Supt5hO55201 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms