Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syngr1O55100 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms