Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom1O54990 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom1O54990 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom1O54990 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prom1O54990 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prom1O54990 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom1O54990 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom1O54990 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom1O54990 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom1O54990 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prom1O54990 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prom1O54990 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prom1O54990 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prom1O54990 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prom1O54990 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.2 ms