Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SGTAO43765 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGTAO43765 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGTAO43765 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGTAO43765 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGTAO43765 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGTAO43765 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGTAO43765 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTAO43765 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTAO43765 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTAO43765 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTAO43765 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTAO43765 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTAO43765 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTAO43765 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTAO43765 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTAO43765 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTAO43765 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGTAO43765 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGTAO43765 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGTAO43765 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGTAO43765 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGTAO43765 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGTAO43765 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGTAO43765 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGTAO43765 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGTAO43765 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGTAO43765 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGTAO43765 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGTAO43765 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGTAO43765 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGTAO43765 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGTAO43765 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGTAO43765 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGTAO43765 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGTAO43765 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGTAO43765 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGTAO43765 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGTAO43765 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGTAO43765 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGTAO43765 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGTAO43765 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGTAO43765 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGTAO43765 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGTAO43765 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGTAO43765 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGTAO43765 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGTAO43765 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGTAO43765 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGTAO43765 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGTAO43765 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTAO43765 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTAO43765 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTAO43765 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTAO43765 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTAO43765 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTAO43765 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTAO43765 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTAO43765 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGTAO43765 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGTAO43765 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGTAO43765 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGTAO43765 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGTAO43765 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGTAO43765 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGTAO43765 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGTAO43765 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGTAO43765 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGTAO43765 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGTAO43765 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGTAO43765 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGTAO43765 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms