Protein–RNA interactions for Protein: O35648

Cetn3, Centrin-3, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cetn3O35648 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cetn3O35648 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cetn3O35648 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms