Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NmiO35309 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NmiO35309 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NmiO35309 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NmiO35309 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NmiO35309 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NmiO35309 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NmiO35309 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NmiO35309 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NmiO35309 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NmiO35309 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NmiO35309 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NmiO35309 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NmiO35309 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NmiO35309 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NmiO35309 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NmiO35309 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NmiO35309 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NmiO35309 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NmiO35309 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NmiO35309 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NmiO35309 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NmiO35309 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NmiO35309 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NmiO35309 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NmiO35309 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NmiO35309 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NmiO35309 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NmiO35309 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NmiO35309 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NmiO35309 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NmiO35309 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NmiO35309 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NmiO35309 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NmiO35309 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NmiO35309 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NmiO35309 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NmiO35309 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NmiO35309 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NmiO35309 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NmiO35309 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NmiO35309 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NmiO35309 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NmiO35309 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NmiO35309 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NmiO35309 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NmiO35309 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NmiO35309 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NmiO35309 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NmiO35309 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NmiO35309 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NmiO35309 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NmiO35309 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NmiO35309 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NmiO35309 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NmiO35309 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NmiO35309 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NmiO35309 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NmiO35309 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NmiO35309 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NmiO35309 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NmiO35309 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NmiO35309 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NmiO35309 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NmiO35309 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NmiO35309 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NmiO35309 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NmiO35309 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NmiO35309 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NmiO35309 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NmiO35309 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NmiO35309 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NmiO35309 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NmiO35309 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NmiO35309 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NmiO35309 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NmiO35309 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NmiO35309 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NmiO35309 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NmiO35309 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NmiO35309 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NmiO35309 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NmiO35309 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NmiO35309 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NmiO35309 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NmiO35309 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NmiO35309 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NmiO35309 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NmiO35309 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NmiO35309 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NmiO35309 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NmiO35309 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NmiO35309 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NmiO35309 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NmiO35309 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NmiO35309 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NmiO35309 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NmiO35309 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms