Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ArxO35085 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ArxO35085 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ArxO35085 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArxO35085 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArxO35085 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArxO35085 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArxO35085 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArxO35085 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArxO35085 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArxO35085 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArxO35085 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArxO35085 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ArxO35085 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ArxO35085 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ArxO35085 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ArxO35085 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArxO35085 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArxO35085 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArxO35085 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArxO35085 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArxO35085 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArxO35085 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArxO35085 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArxO35085 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ArxO35085 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ArxO35085 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ArxO35085 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ArxO35085 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ArxO35085 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ArxO35085 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ArxO35085 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ArxO35085 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ArxO35085 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArxO35085 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArxO35085 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArxO35085 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArxO35085 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArxO35085 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArxO35085 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ArxO35085 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArxO35085 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArxO35085 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArxO35085 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArxO35085 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArxO35085 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArxO35085 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArxO35085 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArxO35085 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ArxO35085 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ArxO35085 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ArxO35085 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ArxO35085 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ArxO35085 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ArxO35085 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ArxO35085 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ArxO35085 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ArxO35085 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ArxO35085 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ArxO35085 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ArxO35085 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ArxO35085 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ArxO35085 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ArxO35085 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ArxO35085 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ArxO35085 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ArxO35085 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ArxO35085 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ArxO35085 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ArxO35085 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ArxO35085 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ArxO35085 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArxO35085 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArxO35085 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArxO35085 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArxO35085 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArxO35085 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ArxO35085 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArxO35085 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArxO35085 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArxO35085 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ArxO35085 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ArxO35085 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ArxO35085 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ArxO35085 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ArxO35085 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ArxO35085 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ArxO35085 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ArxO35085 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ArxO35085 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ArxO35085 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ArxO35085 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ArxO35085 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ArxO35085 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ArxO35085 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ArxO35085 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ArxO35085 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ArxO35085 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ArxO35085 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ArxO35085 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms