Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LhbO09108 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LhbO09108 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LhbO09108 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LhbO09108 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LhbO09108 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LhbO09108 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LhbO09108 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LhbO09108 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LhbO09108 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LhbO09108 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LhbO09108 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LhbO09108 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LhbO09108 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LhbO09108 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LhbO09108 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LhbO09108 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LhbO09108 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LhbO09108 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LhbO09108 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LhbO09108 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LhbO09108 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LhbO09108 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LhbO09108 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LhbO09108 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LhbO09108 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LhbO09108 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LhbO09108 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LhbO09108 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LhbO09108 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LhbO09108 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LhbO09108 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LhbO09108 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LhbO09108 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LhbO09108 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LhbO09108 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LhbO09108 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LhbO09108 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LhbO09108 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LhbO09108 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LhbO09108 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LhbO09108 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LhbO09108 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LhbO09108 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LhbO09108 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LhbO09108 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LhbO09108 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LhbO09108 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LhbO09108 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LhbO09108 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LhbO09108 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LhbO09108 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LhbO09108 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LhbO09108 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LhbO09108 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LhbO09108 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LhbO09108 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LhbO09108 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LhbO09108 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LhbO09108 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LhbO09108 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LhbO09108 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LhbO09108 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LhbO09108 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LhbO09108 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LhbO09108 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LhbO09108 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LhbO09108 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LhbO09108 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LhbO09108 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LhbO09108 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LhbO09108 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LhbO09108 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LhbO09108 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms