Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3488M0QW81 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Gm3488M0QW81 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Gm3488M0QW81 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3488M0QW81 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Gm3488M0QW81 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Gm3488M0QW81 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Gm3488M0QW81 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Gm3488M0QW81 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3488M0QW81 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms