Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm21310J3QQ23 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm21310J3QQ23 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm21310J3QQ23 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm21310J3QQ23 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm21310J3QQ23 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm21310J3QQ23 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21310J3QQ23 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm21310J3QQ23 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm21310J3QQ23 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm21310J3QQ23 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm21310J3QQ23 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm21310J3QQ23 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21310J3QQ23 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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