Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm379J3QQ19 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm379J3QQ19 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm379J3QQ19 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm379J3QQ19 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm379J3QQ19 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Gm379J3QQ19 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Gm379J3QQ19 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Gm379J3QQ19 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Gm379J3QQ19 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Gm379J3QQ19 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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Gm379J3QQ19 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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Gm379J3QQ19 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm379J3QQ19 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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Gm379J3QQ19 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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Gm379J3QQ19 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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Gm379J3QQ19 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Gm379J3QQ19 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Gm379J3QQ19 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm379J3QQ19 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm379J3QQ19 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm379J3QQ19 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm379J3QQ19 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm379J3QQ19 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm379J3QQ19 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm379J3QQ19 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm379J3QQ19 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm379J3QQ19 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm379J3QQ19 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm379J3QQ19 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm379J3QQ19 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm379J3QQ19 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm379J3QQ19 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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