Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2056J3QQ02 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.6 ms