Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3415J3QMS8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3415J3QMS8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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