Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm11236J3QMS7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm11236J3QMS7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms