Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r76F8VQ63 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r76F8VQ63 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms