Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP0

Zfp708, Zinc finger protein 708, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp708F8VPP0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp708F8VPP0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp708F8VPP0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms