Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tarbp1E9Q368 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tarbp1E9Q368 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tarbp1E9Q368 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tarbp1E9Q368 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms