Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrp3E9Q1T6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrp3E9Q1T6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrp3E9Q1T6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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