Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sbf2E9PXF8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sbf2E9PXF8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sbf2E9PXF8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sbf2E9PXF8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbf2E9PXF8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbf2E9PXF8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms