Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfta2E9PXB6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfta2E9PXB6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfta2E9PXB6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfta2E9PXB6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfta2E9PXB6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfta2E9PXB6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfta2E9PXB6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfta2E9PXB6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfta2E9PXB6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sfta2E9PXB6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sfta2E9PXB6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfta2E9PXB6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfta2E9PXB6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfta2E9PXB6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfta2E9PXB6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfta2E9PXB6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sfta2E9PXB6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms