Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc17E9PVB5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms