Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240 ms