Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc6D3YZP9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc6D3YZP9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc6D3YZP9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms