Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ppfia4B8QI36 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia4B8QI36 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia4B8QI36 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms