Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20547B8JJN0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20547B8JJN0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms