Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp26c1B2RXA7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp26c1B2RXA7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms